Таргетное секвенирование

GenSeq™ Library Kit v1.1 создан для таргетного секвенирования на платформах Illumina и Ion Torrent, имеет простой протокол подготовки библиотек. Универсальный подход позволяет выбирать платформу для секвенирования в процессе создания библиотек.

В основе принципа работы набора лежит обогащение целевых участков ДНК методом мультиплексной ПЦР (на основе панелей AmpliSeq™), которое гарантирует высокое качество данных при минимальной потребности к количеству входящего материала. Для проведения мультиплексной ПЦР амплификации при работе с 1 пулом праймеров достаточно 1-10 нг ДНК.

В случае секвенирования на платформе Ion Torrent протокол GenSeq™ Library Kit v1.1 позволяет использовать баркоды Ion Xpress™ Barcode Adapters (доступно до 96 вариантов баркодов). В случае секвенирования на платформе Illumina индексирование образцов проводится с использованием набора GenSeq™ Index Primers (двойное индексирование, 96 комбинаций индексов).

Удобный формат наборов на 24/48/96/384 реакции подходит для широкого круга задач. Хранение 12 месяцев помогает решать задачи в течение целого года.

Новая версия набора - GenSeq™ Library Kit v1.1 позволяет расходовать в два раза меньше магнитных частиц при очистке продукта реакции, что делает использование набора еще более выгодным.

Схема процесса создания библиотек при помощи набора GenSeq™ Library Kit  для секвенирования на платформах Ion Torrent и Illumina.

Результат секвенирования на платформе Ion Torrent (Ion PGM™) при работе с различными панелями праймеров Custom AmpliSeq.

Библиотеки GenSeq™ Library Kit. Панели A, B, C, D, E, F на различных образцах ДНК:
Панель A (Project 1) 508 amplicons (1 pool) Read Length: 175 bp	Панель D (Project 4, 8) 127 amplicons (2 pool) Read Length: 225 bp
Панель B (Project 2, 9) 538 amplicons (1 pool) Read Length: 275 bp	Панель E (Project 6) 384 amplicons (2 pool) Read Length: 375 bp
Панель С (Project 3, 5) 226 amplicons (2 pool) Read Length: 375 bp	Панель F (Project 7) 1255 amplicons (2 pool) Read Length: 275 bp

Результат секвенирования на платформе Ion Torrent (Ion PGM™). На выборке образцов ДНК различного качества. Панель С.

Панель праймеров С. Образцы ДНК 1-23

Результаты секвенирования Панели B на платформах Ion Torrent (Ion PGM™) и Illumina (MiSeq™). GenSeq™ Library Kit. Количество ДНК 1 нг.

Панель праймеров B. Результаты секвенирования на приборах Ion PGM™ и MiSeq™

Показана высокая воспроизводимость у двух разных образцов, библиотеки для которых, были приготовлены с помощью набора GenSeq™ Library Kit

Высокая корреляция профилей покрытия образцов GenSeq™ Library Kit

Производителем набора GenSeq™ Library Kit v1.1 является российская компания «ANPRO». Узнать больше вы можете на сайте http://anpro.group/

Информация для заказа:

GEN-24 - GenSeq™ Library Kit v1.1 24 rx, конструктор таргетных ДНК библиотек (GenSeq™ КТДБ). Служит для быстрого приготовления библиотек ампликонов с использованием мультиплексных панелей праймеров AmpliSeq™ на приборах Illumina и Ion Torrent. Усовершенствованная реакционная смесь позволяет проводить амплификацию множества ПЦР-мишеней в одной пробирке. Достаточно 1-10 нг ДНК на библиотеку. Данный набор реагентов может быть использован совместно с различными панелями праймеров AmpliSeq. Набор рассчитан на 24 реакции.

GEN-48 - GenSeq™ Library Kit v1.1 48 rx, конструктор таргетных ДНК библиотек (GenSeq™ КТДБ). Служит для быстрого приготовления библиотек ампликонов с использованием мультиплексных панелей праймеров AmpliSeq™ на приборах Illumina и Ion Torrent. Усовершенствованная реакционная смесь позволяет проводить амплификацию множества ПЦР-мишеней в одной пробирке. Достаточно 1-10 нг ДНК на библиотеку. Данный набор реагентов может быть использован совместно с различными панелями праймеров AmpliSeq. Набор рассчитан на 48 реакций.

GEN-96 - GenSeq™ Library Kit v1.1 96 rx, конструктор таргетных ДНК библиотек (GenSeq™ КТДБ). Служит для быстрого приготовления библиотек ампликонов с использованием мультиплексных панелей праймеров AmpliSeq™ на приборах Illumina и Ion Torrent. Усовершенствованная реакционная смесь позволяет проводить амплификацию множества ПЦР-мишеней в одной пробирке. Достаточно 1-10 нг ДНК на библиотеку. Данный набор реагентов может быть использован совместно с различными панелями праймеров AmpliSeq. Набор рассчитан на 96 реакций.

GEN-384 - GenSeq™ Library Kit v1.1 384 rx, конструктор таргетных ДНК библиотек (GenSeq™ КТДБ). Служит для быстрого приготовления библиотек ампликонов с использованием мультиплексных панелей праймеров AmpliSeq™ на приборах Illumina и Ion Torrent. Усовершенствованная реакционная смесь позволяет проводить амплификацию множества ПЦР-мишеней в одной пробирке. Достаточно 1-10 нг ДНК на библиотеку. Данный набор реагентов может быть использован совместно с различными панелями праймеров AmpliSeq. Набор рассчитан на 384 реакции.

GEN-IN-96 - GenSeq™ Index Primer Set, набор индексированных праймеров (GenSeq™ НИП). Необходим для секвенирования на платформе Illumina. Двойное индексирование, 96 комбинаций индексов.